Se debió principalmente a los nacimientos de Hashirama Senju y su hermano Tobirama Senju. Hashirama y Tobirama fueron tan poderosos que inclinaron el equilibrio entre los Senju y los Uchiha.
Finalmente, solo Madara e Izuna Uchiha podrían competir con ellos, y cuando Tobirama mató a Izuna en la batalla, Madara quedó sin ayuda. Muchos Uchiha desertaron y se rindieron a Senju cuando sintieron que ya no podían ganar, y a pesar de que Madara obtuvo el Eterno Mangekyo Sharingan, fue derrotado por los dos hermanos Senju.
Madara finalmente aceptó la oferta de paz de Hashirama, y los dos clanes se aliaron. Sin embargo, eventualmente Hashirama se volvería tan poderoso que Madara ya no podría derrotarlo.
Eventualmente, cuando los clanes decidieron seleccionar un Hokage para liderarlos, los Uchihas traicionaron a Madara y seleccionó a Hashirama, habiendo caído en rumores de que mató a Izuna y tenía hambre de poder, y muchos de ellos simplemente querían la paz.
Sin embargo, esto solo cimentaría el control de Senju sobre los Uchiha como Madara temía, y eventualmente conduciría a la destrucción del clan Uchiha como Madara predijo.
Personalmente, me parece irónico que la fuerza de Hashirama y Tobirama fue lo que terminó poniendo fin a la disputa, porque va en contra de los ideales de Hashirama de que los sentimientos pueden lograr la paz sin fuerza bruta / poder bruto. Simplemente sirve para demostrar el punto de Indra.
En serio, la fuerza de Hashirama obligó a los Uchiha a someterse al Senju. Lo que a su vez, provocó una Alianza Senju-Uchiha que básicamente obligó a los otros clanes de la Tierra del Fuego a unirse a ellos también como Konohagakure. Eso, a su vez, hizo que los otros países formaran aldeas.
En resumen, el «poder» de Hashirama provocó este cambio, pero su actitud fue probablemente lo que hizo que sucediera tan bien.
Hashirama se trataba de cooperación y seguridad, no de control y poder. Su comportamiento desinteresado hizo que otros quisieran apoyarlo y trabajar para él. Incluso realistas como Tobirama vieron el potencial en la visión de Hashirama y trataron de sacar lo mejor de ella.
En serio, dudo que algo hubiera sucedido si Hashirama no fuera tan OP. Tobirama era comprensible, porque es una expectativa realista para un nivel de Kage, pero Hashirama es retrasado OP. Su nivel de poder es tan enorme que su simple existencia redefinió la cadena alimentaria de los clanes shinobi.
Básicamente, es como una empresa que consigue un CEO tan bueno que convencen a su competencia de fusionarse con ellos. Es como Apple convencer a Samsung de fusionarse, es como «está hecho».
Si la presencia misma del CEO causa esto, esa es una metáfora precisa de lo que sucedió con Senju y Uchiha, Hashirama fue «demasiado bueno» que causó que los Uchiha, y por lo tanto, el resto de los clanes shinobi dijeran «GG».